Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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