Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6044-201ENSMUST00000121819 499 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22943-201ENSMUST00000158564 76 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp939-201ENSMUST00000061201 2131 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Ece2-208ENSMUST00000120394 3432 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gtpbp6Q3U6U5 Rcbtb2-218ENSMUST00000169479 3351 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gtpbp6Q3U6U5 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms