Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
P10404 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms