Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms