Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms