Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc6D3YZP9 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms