Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Clip3B9EHT4 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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