Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms