Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms