Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms