Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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