Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SgshQ9EQ08 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188 ms