Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Ccer1Q9CQL2 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccer1Q9CQL2 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccer1Q9CQL2 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccer1Q9CQL2 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccer1Q9CQL2 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccer1Q9CQL2 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccer1Q9CQL2 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccer1Q9CQL2 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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