Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hpf1Q8CFE2 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hpf1Q8CFE2 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hpf1Q8CFE2 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hpf1Q8CFE2 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hpf1Q8CFE2 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Hpf1Q8CFE2 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Hpf1Q8CFE2 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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Hpf1Q8CFE2 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hpf1Q8CFE2 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms