Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Atg4aQ8C9S8 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Atg4aQ8C9S8 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Atg4aQ8C9S8 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Atg4aQ8C9S8 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Atg4aQ8C9S8 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Atg4aQ8C9S8 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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