Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gga3Q8BMI3 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms