Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Hoxa13Q62424 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms