Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Rbbp4Q60972 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Rbbp4Q60972 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Rbbp4Q60972 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Rbbp4Q60972 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms