Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Tsr1Q5SWD9 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Tsr1Q5SWD9 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Tsr1Q5SWD9 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Tsr1Q5SWD9 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Tsr1Q5SWD9 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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