Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Usp48Q3V0C5 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp48Q3V0C5 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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