Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms