Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms