Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ttc39dQ0VF76 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ttc39dQ0VF76 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ttc39dQ0VF76 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ttc39dQ0VF76 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ttc39dQ0VF76 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ttc39dQ0VF76 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ttc39dQ0VF76 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ttc39dQ0VF76 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ttc39dQ0VF76 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ttc39dQ0VF76 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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Ttc39dQ0VF76 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ttc39dQ0VF76 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms