Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Siah1bQ06985 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms