Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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