Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms