Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PtprmP28828 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PtprmP28828 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms