Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
P10404 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
P10404 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
P10404 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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