Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
H2-Eb1P04230 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms