Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Gm21060J3KMU4 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms