Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms