Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Smg9Q9DB90 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Smg9Q9DB90 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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