Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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