Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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