Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Top1mtQ8R4U6 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Top1mtQ8R4U6 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Top1mtQ8R4U6 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Top1mtQ8R4U6 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Top1mtQ8R4U6 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Top1mtQ8R4U6 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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