Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Trappc12Q8K2L8 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Trappc12Q8K2L8 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Trappc12Q8K2L8 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Trappc12Q8K2L8 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Trappc12Q8K2L8 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Trappc12Q8K2L8 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Trappc12Q8K2L8 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Trappc12Q8K2L8 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Trappc12Q8K2L8 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms