Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Atg4aQ8C9S8 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Atg4aQ8C9S8 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Atg4aQ8C9S8 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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