Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Usp49Q6P9L4 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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