Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms