Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VdrP48281 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
VdrP48281 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
VdrP48281 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
VdrP48281 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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VdrP48281 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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VdrP48281 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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VdrP48281 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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VdrP48281 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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VdrP48281 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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