Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SrprbP47758 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SrprbP47758 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms