Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
RxraP28700 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms