Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm340F6RGI3 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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