Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms