Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Prrt4B2RU40 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms