Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Spocd1B1ASB6 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Spocd1B1ASB6 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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