Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Grik3B1AS29 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms