Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CtcflA2APF3 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CtcflA2APF3 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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