Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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