Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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